Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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H2-M10.5Q85ZW7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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