Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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