Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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