Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ubfd1Q78JW9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
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Ubfd1Q78JW9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubfd1Q78JW9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubfd1Q78JW9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Ubfd1Q78JW9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ubfd1Q78JW9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms