Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms