Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms