Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CtifQ6PEE2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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