Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smchd1Q6P5D8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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