Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sos1Q62245 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sos1Q62245 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sos1Q62245 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sos1Q62245 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms