Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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SspnQ62147 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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SspnQ62147 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SspnQ62147 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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SspnQ62147 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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SspnQ62147 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SspnQ62147 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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SspnQ62147 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SspnQ62147 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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