Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
JrkQ60976 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms