Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3Q60803 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms