Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PtprnQ60673 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms