Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Tsr1Q5SWD9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tsr1Q5SWD9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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