Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm11487Q5RIS0 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm11487Q5RIS0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms