Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam220aQ3ZN08 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms