Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Kdm5aQ3UXZ9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Kdm5aQ3UXZ9 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms