Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
D130052B06RikQ3UW13 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
D130052B06RikQ3UW13 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms