Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Znf48Q3US17 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Znf48Q3US17 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Znf48Q3US17 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Znf48Q3US17 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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