Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Nkx6-3Q3UHX8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nkx6-3Q3UHX8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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