Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q3U6N9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms