Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc9Q3U0M1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms