Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Fndc4Q3TR08 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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