Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trappc13Q3TIR1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms