Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trim71Q1PSW8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trim71Q1PSW8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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