Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cers3Q1A3B0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cers3Q1A3B0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms