Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rundc1Q0VDN7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms