Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vps8Q0P5W1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vps8Q0P5W1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms