Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Tff1Q08423 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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