Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cntn3Q07409 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cntn3Q07409 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cntn3Q07409 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cntn3Q07409 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms