Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Siah1bQ06985 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms