Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Sh3bp2Q06649 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sh3bp2Q06649 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sh3bp2Q06649 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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