Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Thbs3Q05895 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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