Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sox12Q04890 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms