Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Emx2Q04744 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms