Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Nf1Q04690 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms