Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Fgfr4Q03142 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Fgfr4Q03142 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms