Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mmp11Q02853 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms