Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms