Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EgfrQ01279 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms