Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoa1Q00623 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms