Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pitx2P97474 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms