Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Psme1P97371 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme1P97371 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psme1P97371 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms