Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Arf1P84078 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Arf1P84078 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms