Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Tp53bp1P70399 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms