Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chl1P70232 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chl1P70232 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chl1P70232 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms