Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Arf6P62331 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms