Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Kcnn3P58391 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms