Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp25P57080 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp25P57080 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms