Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gsc2P56916 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms